Nghị định gồm ba chương, 17 điều, quy định rõ đối tượng áp dụng là tổ chức,cá nhân thực hiện xuất khẩu, nhập khẩu hàng hóa thương mại; cơ quan hải quan,công chức hải quan và cơ quan khác của Nhà nước, trong việc phối hợp quản lý nhànước về hải quan.
Người khai hải quan điện tử được thực hiện khai hải quan điện tử 24 giờ trongngày, bảy ngày trong tuần và nhận thông tin phản hồi của cơ quan hải quan trựctiếp qua hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan.
Trường hợp khai hải quan trong thời gian nghỉ theo quy định của pháp luật, nhưngthuộc diện phải nộp, xuất trình chứng từ thuộc bộ hồ sơ hải quan để cơ quan hảiquan kiểm tra, làm cơ sở thực hiện các thủ tục tiếp theo thì được phản hồi kếtquả chậm nhất 4 giờ, kể từ thời điểm bắt đầu ngày làm việc kế tiếp.
Người khai hải quan điện tử phải thực hiện việc lưu giữ chứng từ điện tửthuộc hồ sơ hải quan theo quy định của Luật giao dịch điện tử và các văn bản quyphạm pháp luật có liên quan; cung cấp các chứng từ điện tử có liên quan đến hànghóa xuất khẩu, nhập khẩu cho cơ quan hải quan, để phục vụ công tác kiểm tra,thanh tra theo thẩm quyền.
Khi xảy ra sự cố với hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan, cơ quan hảiquan có trách nhiệm thông báo trên trang thông tin điện tử ngành hải quan chậmnhất 2 giờ kể từ thời điểm xảy ra sự cố đối với những sự cố xảy ra trong giờhành chính, hoặc 2 giờ kể từ thời điểm bắt đầu ngày làm việc tiếp theo đối vớinhững sự cố xảy ra trong thời gian nghỉ theo quy định của pháp luật, đồng thờitạo điều kiện để người khai hải quan thực hiện thủ tục hải quan bằng phương thứcthủ công.
Các bộ, cơ quan nhà nước liên quan có trách nhiệm phối hợp chuẩn hóa, cungcấp và trao đổi thông tin liên quan đến hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu với cơquan Hải quan để thực hiện thủ tục hải quan điện tử quy định tại Nghị đình này,thực hiện cơ chế một cửa ASEAN và cơ chế hải quan một cửa quốc gia.
Nghị định này có hiệu lực thi hành từ ngày 1/1/2013./.